Creada en 1.975 con el fin de ofrecer una sólida formación en ciencias básicas, naturales y exactas. Inicialmente estuvo integrada por los Departamentos de Matemáticas, Física, Química, Biología y Ciencias de la Tierra. En 1983 se fundó el Instituto de Ciencias Naturales y Ecología - ICNE, para impulsar el trabajo interdisciplinario. Hoy la Facultad de Ciencias cuenta con las siguientes unidades académicas: Biociencias, Ciencias Naturales, Estadística, Enseñanza de las Ciencias, Física, Geociencias, Matemáticas y Química. Ofrece formación desde pregrado hasta el nivel doctoral.